Analisis kemurnian dan konsentrasi DNA hasil isolasi pada pembuatan DNA baku spesies tikus
Analisis kemurnian dan konsentrasi DNA hasil isolasi pada pembuatan DNA baku spesies tikus
DOI:
https://doi.org/10.54384/eruditio.v1i2.75Kata Kunci:
DNA, Tikus, Isolasi, Intron, DNA, Tikus, Isolasi, IntronAbstrak
Analisis kemurnian dan konsentrasi DNA hasil isolasi pada pembuatan DNA baku spesies tikus dilakukan untuk melihat apakah isolasi yang dilakukan dapat menghasilkan kualitas DNA yang baik. Tujuan dari penelitian ini adalah memberi infomasi mengenai pembuatan DNA baku pada pengujian DNA spesies dimana baku yang selama ini dibeli yang dibuat dari bahan sintetik dapat lebih ekonomis jika menggunakan bahan DNA yang berasar dari raw material daging spesies target. Metode esktraksi DNA yang dilakukan adalah metode spin kolom atau centrifuge kolom dengan menggunakan kit ekstraksi Intron Patho Gene-Spin (Viral DNA/RNA). Metode analysis konsentrasi dan kemurnian DNA hasil isolasi dianalisis berdasarkan nilai rata-rata konsentrasi dan kemurnian yang dibaca menggunakan nanophotometer. Berdasarkan hasil penelitian yang dilakukan, diperoleh hasil nilai konsentrasi DNA hasil isolasi berada pada rentang konsentrasi 41.250 ng/mL sampai 42.300 ng/mL, dengan rata-rata konsentrasi DNA hasil isolasi adalah 41.777 ng/mL. Untuk nilai kemurnian DNA hasil isolasi yang dibaca absorbansinya menggunakan nanophotometer pada panjang gelombang A260/A280 diperoleh hasil antara 2.301 sampai dengan 2.384 dengan rata.rata nilai kemurnian berada pada 2.326. Kesimpulan dari penelitian ini adalah semua sampel yang diekstrasi menunjukan hasil analisis DNA yang dihasilkan masuk dalam kategori DNA yang baik.
Unduhan
Referensi
Abinawanto, Sophian, A., Lestari, R., Bowolaksono, A., Efendi, P. S., & Afnan, R. (2019). Analysis of IGF-1 gene in ayam ketawa (Gallus gallus domesticus) with dangdut and slow type vocal characteristics. Biodiversitas, 20(7), 2004–2010. https://doi.org/10.13057/biodiv/d200729
Aminah, A., Ramadini, R., & Naid, T. (2019). Analisis Cemaran DNA Tikus pada Bakso Daging Sapi yang Beredar di Makassar dengan Metode Polymerase Chain Reaction (PCR). Jurnal Farmasi Galenika (Galenika Journal of Pharmacy) (e-Journal), 5(1), 93–100. https://doi.org/10.22487/j24428744.2019.v5.i1.12036
Eppendorf. (2016). Nucleic Acid Photometry. 22331.
Intron. (2020). Patho Gene-spin TM DNA / RNA Extraction Kit. 1–2.
Matlock, B. (2015). Assessment of Nucleic Acid Purity. Technical Bulletin NanoDrop Spectrophotometers, 1–2.
Qiagen®. (2014). DNeasy® Mericon® Food Handbook. 06(February), 18–19.
Rohman, A., Rahayu, W. S., Sudjadi, & Martono, S. (2021). The use of real-time polymerase chain reaction combined with specific-species primer for analysis of dog meat dna in meatball. Indonesian Journal of Chemistry, 21(1), 225–233. https://doi.org/10.22146/ijc.48930
Septiani, T. (2021). Identification of Rat Meatballs in Traditional Market in Area of Jakarta Using Real Time – Pcr. Indonesia Journal of Halal, 3(1), 94–99. https://ejournal2.undip.ac.id/index.php/ijh/article/view/9244
Sophian, A. (2021). Short Communication: Analysis of purity and concentration of extracted DNA on salted fish processed food products. Asian Journal of Natural Product Biochemistry, 19(1), 21–24. https://doi.org/10.13057/biofar/f190104
Sophian, A., Purwaningsih, R., Muindar, Igirisa, E. P. J., & Amirullah, M. L. (2021). Short Communication: Analysis of purity and concentration of DNA extracted from intron patho gene-spin extraction on crab processed food product samples. Asian Journal of Tropical Biotechnology, 18(1), 13–27. https://doi.org/10.13057/biotek/c180103
Sophian, A. (2021). Analysis of the Results of DNA Isolation from Chicken Feather Sampled from the Base of the Young Feathers, the base of the Old Feathers and the Ends of the Feathers. BIOEDUSCIENCE, 5(2). https://doi.org/10.22236/j.bes/526211
Suryawan, G. Y., Suardana, I. W., & Wandia, I. N. (2020). Sensitivity of polymerase chain reaction in the detection of rat meat adulteration of beef meatballs in Indonesia. Veterinary World, 13(5), 905–908. https://doi.org/10.14202/vetworld.2020.905-908
University, E. (2020). EIGC . 005 _ Quantitation with NanoDrop Standard Operating Procedure Staff Review Page : Standard Operating Procedure Approval Page : Manual Prosedure, 1–5.
